"Citoyen ministre, la nuit du 10 au 11 brumaire a vu terminer les jours du général en chef Leclerc, capitaine général de la colonie de Saint-Domingue. L’armée a perdu en lui un père dont toute la sollicitude n’était que pour son bonheur et sa gloire, et la colonie un administrateur dont toute l’ambition était son entière prospérité. L’armée porte le deuil de la mort de son général, et Saint-Domingue regrettera à jamais celui qui voulait lui assurer le bonheur et la tranquillité."

Dépêche au ministre de la marine rédigée par Norvins (futur historien de Napoléon), qui servait alors comme secrétaire général.

Dans la nuit du 1er au 2 novembre 1802, le Général Leclerc expire. Neuf mois se sont écoulés depuis son arrivée sur l'île. Un destin brisé à trente ans pour ce Général Français de la révolution, époux de Pauline, la soeur de Napoléon Bonaparte.

C'est au siège de Toulon que Leclerc se lie avec Napoléon. Il se distingue par la suite aux armées des Alpes et d'Italie et devient, dés 1797, général de brigade. Le 14 juin 1797, leclerc épouse Pauline Bonaparte dont il aura un fils, Dermide (qui décèdera en 1804). C'est à Leclerc que revient la charge d'annoncer au Directoire la signature des préliminaires de paix de Leoben. Par la suite, il devient chef d'état-major des généraux Berthier et Brune, et passe général de division à l'armée du Rhin sous les ordres de Moreau. Au coup d'État du 18 Brumaire, Leclerc soutient son beau-frère et fait envahir la salle du Conseil des Cinq-Cents par les Grenadiers, appuyé par Murat. Le 24 Octobre 1801, Leclerc est nommé général en chef de l'expédition de Saint-Domingue pour rétablir l'ordre dans cette colonie qui s'était transformée en un état pratiquement autonome sous la gouverne de Toussaint Louverture. Début février 1802, les émeutes éclatent. C'est le début d'une guerre d'usure, sanglante, qui fera des centaines de victimes. Leclerc lance une puissante offensive qui anéantit les troupes de Toussaint-Louverture, comme au siège de la Crête à Pierrot en mars 1802. Les généraux de Toussaint-Louverture cessent le combat les uns après les autres. Toussaint est contraint à négocier sa soumission. Le 7 juin 1802, il est arrêté pour etre emprisonné au Fort de Joux près de Besançon en août 1802. Leclerc s'efforce de réorganiser la colonie. Mais il se heurte à d'énormes difficultés: pénurie d'argent et de matériel, incurie et corruption des administrateurs locaux, conditions sanitaires déplorables. La guerilla se poursuit et prend de l'ampleur à l'annonce du rétablissement de l'esclavage en août 1802. A cette époque, les troupes de Leclerc souffrent du manque de moyens et se trouvent décimées par la fièvre jaune. Face à une insurrection générale lancée en septembre par les généraux noirs, Leclerc avec les quelques milliers de soldats qui lui restent, arrive à sauver Le Cap. Mais il meurt le 2 novembre, fauché à son tour par la fièvre jaune. Sa dépouille mortelle sera ramenée par sa femme Pauline qui l'avait suivi à Saint-Domingue, et inhumée, le 18 ventôse an XI (9 mars 1803), dans le parc du château à Montgobert. Le nom de Leclerc figure au côté Ouest de l'Arc de Triomphe de l'Etoile. "Le capitaine général Leclerc était un officier de premier mérite, propre à la fois au travail du cabinet et aux manoeuvres du champ de bataille. Il avait fait les campagnes de 1796 et 1797, comme adjudant-général auprès de Napoléon ; celle de 1799 sous Moreau, comme général de division. Il commandait au combat de Freisingen, où il battit l’archiduc Ferdinand ; il conduisit en Espagne un corps d’observation de 20.000 hommes, destiné à agir contre le Portugal ; enfin dans cette expédition de Saint-Domingue, il déploya du talent et de l’activité ; en moins de trois mois, il battit et soumit cette armée noire qui s’était illustrée par la défaite d’une armée anglaise." dira de lui l'Empereur, dans le Mémorial de Sainte-Hélène.